Такое исследование возможно только при добровольном информированном участии и с учётом трудовых и персональных данных. До начала специалист выясняет состояние здоровья, принимаемые препараты, утомление и иные факторы, которые могут повлиять на безопасность и реакции. Отказ сотрудника нельзя автоматически считать признанием или доказательством нарушения.
Главное методическое ограничение: полиграф регистрирует физиологические изменения, а не ложь, искренность или причастность. Результат зависит от процедуры и состояния обследуемого. Поэтому внутреннее решение работодателя нельзя основывать только на таком отчёте. Подробные условия рассматриваются на странице исследования с применением полиграфа.