Заключение перечисляет поступившие объекты, их реквизиты и пригодность, восстанавливает медицинскую хронологию и описывает методы исследования. В нём должны быть отделены подтверждённые документами факты, сообщения участников и ограничения исходных данных. Изображения и измерения связываются с конкретными файлами и датами.
В исследовательской части эксперт сопоставляет диагностику, план, вмешательства и наблюдение с применимыми на соответствующий период требованиями. Возможные дефекты описываются предметно; осложнение и неблагоприятный исход не выдаются за доказательство нарушения. Причинная связь проверяется для каждого последствия с анализом альтернативных причин.
Итог не обязан подтверждать позицию заказчика: вывод может установить наличие или отсутствие дефекта и связи, быть условным либо сообщать о невозможности ответа. После назначения судом заключение оценивается вместе с другими доказательствами по правилам процесса; оно не имеет заранее установленной силы. Общие требования к судебной экспертизе изложены в обзоре Федерального закона № 73-ФЗ.