Часто можно. Объём ответа зависит от того, какие взаимосвязанные источники сохранились. Банковские выписки, договоры, документы контрагентов, инвентаризационные материалы, регистры и отчётность позволяют проверить часть операций даже при отсутствии отдельных первичных документов.
Электронный учёт сам по себе не является препятствием. Для расчёта нужны штатные выгрузки с понятными параметрами либо копия базы. Если спор касается удаления записей, времени изменений или действий пользователей, бухгалтеру требуется помощь специалиста по экспертизе 1С. Недостающие сведения нельзя «восстановить» предположением: в заключении эксперт укажет, какая часть ответа подтверждается, а какая ограничена составом материалов.