Перечень зависит от проверяемой версии. Могут понадобиться спорная продукция, образцы сырья, воды, упаковки или пробы из предполагаемых источников загрязнения. Однако передавать всё подряд не нужно: сначала определяют, какие сравнения помогут ответить на вопрос и как получить пригодные пробы. Наличие одинакового вида микроорганизма в разных объектах ещё не доказывает перенос от одного к другому.
Полезны маркировка и сведения о партии, акты отбора с обозначением точек и времени, прежние протоколы, документы о производстве, перевозке, хранении и вскрытии упаковок. Для сравнения важны сопоставимость проб и история обращения с ними. При подозрении на пищевое отравление лабораторные результаты рассматриваются вместе с медицинскими и эпидемиологическими данными; частная экспертиза не заменяет расследование уполномоченных служб.
Начать можно с описания ситуации и доступных копий, без готового комплекта и самостоятельного отбора. Тару, объём проб, точки отбора и условия доставки согласуют заранее. После назначения экспертизы новые объекты и документы передают в порядке, установленном назначившим органом; напрямую отправлять их назначенному эксперту по инициативе стороны не следует.