Начните с конкретного расхождения: не учтена редакция проекта, нет источника цены, объёмы не связаны с чертежами или вывод не следует из расчёта. Для проверки методики и обоснования можно заказать рецензию на заключение строительной экспертизы. Рецензент исследует готовый документ и доступные исходные материалы; если нужны новые обмеры или самостоятельный расчёт по другому заданию, объём исследования согласуют отдельно.
Несогласие с итоговой суммой само по себе не доказывает ошибку. Сначала сопоставляют вопросы, объект, даты, версии и принятые основания расчёта. В судебном деле замечания можно использовать при подготовке ходатайства о разъяснении выводов, дополнительной или повторной экспертизе; решение принимает суд. Подготовьте полное заключение с приложениями, документ о назначении и доступные материалы, на которых оно основано, а также перечень проверяемых расхождений.