MP3, WMA, OGG и другие сжатые файлы исследовать можно. Ограничения зависят от задачи: установить слова, сравнить говорящих и проверить техническую целостность — не одно и то же. Сжатие с потерями удаляет часть сигнала и меняет спектральные характеристики, а повторное кодирование усиливает эти изменения.
Не преобразуйте такой файл в WAV ради «улучшения»: новый контейнер не вернёт потерянные данные. Передайте самую раннюю доступную версию и сведения о приложении или устройстве, которое её создало. Эксперт сначала оценит разборчивость, длительность речи, канал и характер артефактов, а затем определит применимые методы. Итог может быть полноценным, ограниченным отдельными признаками либо сообщать о невозможности ответа на конкретный вопрос.