Связаны, и решать их в отрыве друг от друга обычно бессмысленно.
Порядок пользования участком строится вокруг того, кто какими помещениями пользуется: перед входом в помещение должна находиться часть того, кто через этот вход ходит; хозяйственные постройки логично оставлять за тем, кто ими пользуется.
Если порядок пользования домом уже определён решением суда или сложился фактически, он принимается как исходное условие. Если нет, стоит ставить обе задачи одновременно — иначе второе решение может оказаться несовместимым с первым.
Технически это разные исследования: планировка и назначение помещений исследуются иначе, чем территория. Но выполняются они согласованно, и заключение показывает, как варианты по дому и по участку соотносятся между собой.