Намеренное изменение тембра, шёпот, фальцет, подражание, зажатая артикуляция или электронное преобразование усложняют сравнение. Часть признаков контролируется говорящим, часть изменяется вместе со способом фонации, а часть устойчивых речевых навыков может сохраняться. Поэтому маскировка не означает ни гарантированного исключения, ни гарантированной идентификации.
В идентификационном исследовании описывают наблюдаемые изменения звучания и оценивают их влияние на пригодность и сопоставимость материала. Сравнение выполняют лишь методами, применимость которых подтверждена для соответствующего типа фонации, языка и канала; иначе вопрос может оказаться нерешаемым. Нужны записи естественной речи проверяемого лица, а при наличии — образцы с похожим способом произнесения и сведения об обстоятельствах.
Факт и способ электронного преобразования исследуют как отдельную техническую или диагностическую задачу, а намерение говорящего скрыть личность по фонограмме не устанавливают. Если есть версия о синтезе, идентификационная задача отделяется от исследования способа формирования записи. Сходство с голосом проверяемого лица не доказывает, что речь была естественно произнесена этим человеком. Может потребоваться комплексная проверка исходного файла, следов обработки и доступных естественных участков речи.