Логический дамп сохраняет выбранную структуру и данные в форме команд или файлов выгрузки. Его состав зависит от параметров, фильтров, прав, согласованности снимка и того, включены ли триггеры, события и хранимые программы. Дамп удобен для сравнения таблиц и переноса между средами, но не является побайтовой копией каталога данных и обычно не содержит binary log и конфигурацию сервера.
Физическая копия сохраняет файлы СУБД и может быть необходима для исследования состояния InnoDB или восстановления экземпляра. Её пригодность зависит от точной версии и штатного способа создания: простое копирование каталога работающего сервера способно дать несогласованный набор. Исходную копию сохраняют неизменной; отдельно фиксируют способ, команду и журнал её создания, манифест и криптографические хэш-значения с указанием алгоритма. Восстановление выполняют на отдельном совместимом стенде.