В зависимости от вида процесса экспертизу назначает суд, судья, следователь, дознаватель, иной уполномоченный орган или должностное лицо. Тот, кто назначает экспертизу, определяет окончательные вопросы, выбирает эксперта или учреждение и направляет материалы. Участники могут предлагать вопросы, кандидатуру и образцы через ходатайство.
Внесудебное исследование заказывает гражданин или организация по договору. Оно помогает оценить ситуацию до иска, подготовить переговорную позицию или проверить документ, но не становится судебной экспертизой только из-за своего названия.
Если экспертиза уже назначена, одной стороне нельзя отдельно передавать эксперту новые материалы или получать у него частный прогноз. Всё, что относится к исследованию, направляют через того, кто назначил экспертизу.