Выбор зависит не от вывески учреждения, а от задачи и квалификации конкретного эксперта. Судебную экспертизу могут проводить государственные учреждения, негосударственные организации и эксперты вне учреждения, если соблюдены требования соответствующего процесса.
Сравните образование и подготовку эксперта, опыт работы с нужным объектом, наличие оборудования, возможность принять оригиналы от того, кто назначил экспертизу, а также срок и стоимость. Отдельно спросите, какие признаки будут описаны и как эксперт обоснует связь между исследованием и выводом. Государственный или независимый статус сам по себе не гарантирует объективность и качество.
Для досудебной оценки можно обратиться к выбранному специалисту по договору. Если затем потребуется судебная экспертиза, конкретного исполнителя и окончательные вопросы определит суд, иной уполномоченный орган или должностное лицо.