Наиболее значимы ошибки, которые мешают проверить ход исследования или могли повлиять на вывод. К ним относятся отсутствие оценки пригодности краткой подписи, использование недостоверных или несопоставимых образцов, игнорирование естественной вариационности, неполное описание общих и частных признаков, необъяснённые различия и вывод, не соответствующий исследовательской части.
Отдельно проверяются качество фототаблицы, корректность исследования по копии и обоснованность степени категоричности ответа. Формальная опечатка или отличие оформления само по себе не делает экспертизу ошибочной. В хорошей рецензии каждое замечание связано с конкретной страницей заключения и объяснено его значение: недостаток может быть несущественным, требовать пояснения эксперта, ограничивать определённость либо ставить под сомнение обоснованность вывода.