Это свойство самих объектов, а не небрежность исполнителей. Контур длиной в десятки километров описывается большим числом характерных точек, и погрешность отдельных из них накапливается, проявляясь на локальных отрезках.
Добавьте возраст документации: землеотвод под дороги нередко выполнялся десятилетия назад методами, точность которых ниже современной. Добавьте смену систем координат — пересчёт из местных и устаревших систем сам по себе даёт смещения, особенно когда параметры перехода восстанавливались приближённо.
Существенно и то, что границы полосы отвода часто описывались относительно оси дороги, а ось смещалась при ремонтах и реконструкции. Наконец, участки полосы отвода вносились в реестр по частям и в разное время, и стыки между ними согласованы не всегда.
Поэтому сам по себе факт наложения ничего не решает: значение имеет его причина.