Это разные объекты. Домен — адрес и право его администрировать по договору с регистратором; его стоимость определяется свойствами имени — зоной, длиной, смыслом, возрастом — и считается сравнительным подходом по продажам похожих имён. Проект — домен вместе с сайтом, содержимым, аудиторией, позициями в поиске, базой клиентов и доходом; его стоимость считается доходным подходом по тому, что проект приносит.
Стоимость проекта может превышать стоимость домена многократно, а может почти совпадать с ней, если доход держится на платной рекламе и исчезает вместе с бюджетом. Поэтому в задании и в вопросе суду указывают состав объекта: только домен, домен с сайтом или проект целиком с базой клиентов и правами на содержимое.
Если состав не определён, стороны спорят не о цене, а о том, что оценивалось, и в таком споре не устоит ни один из расчётов.