Различаются принципиально, и это самая дорогая ошибка в таких оценках.
Специализированный станок, встроенный в технологическую цепочку конкретного производства, вне её может не иметь покупателя вовсе. Его стоимость в составе действующего комплекса и стоимость после демонтажа отличаются кратно.
Поэтому до начала работы определяется предпосылка оценки: объект оценивается как часть действующего комплекса или как отдельная единица, подлежащая реализации. От этого зависит и выбор подхода, и результат.
Для банкротных торгов вопрос особенно важен: реализация линии единым лотом и распродажа по единицам дают существенно разные суммы, и оценка должна прямо отвечать, какой вариант рассматривается. Иногда полезно посчитать оба.
Практический совет: указывайте предпосылку в вопросе явно. Отчёт, где она не названа, применим не ко всякой ситуации, и оппонент этим воспользуется.