Отсутствие части первичных документов ограничивает исследование, но не всегда делает его невозможным. Эксперт составляет карту источников: сопоставляет регистры с полными банковскими выписками, договорами, документами контрагентов, складскими и производственными данными. Независимый источник может подтвердить отдельную операцию, но не заменяет отсутствующего комплекта документов.
Поэтому нельзя считать каждую запись ложной или подтверждённой одной оборотно-сальдовой ведомостью. Вывод возможен по сохранившимся операциям, ограниченному периоду или вариантам, основанным на прямо заданных судом либо заказчиком внесудебного исследования условиях. В заключении перечисляют пробелы и их влияние на ответы. Недостающие материалы эксперт запрашивает через орган или лицо, назначившие экспертизу.