Проверка идёт по цепочке из трёх звеньев, и разрыв возможен в любом.
Отчётность — регистры. Показатели форм отчётности сопоставляются с данными оборотно-сальдовых ведомостей и главной книги. Расхождение здесь означает, что отчётность составлена не по учёту.
Регистры — первичные документы. Записи проверяются по договорам, накладным, актам, платёжным документам. Разрыв означает записи без основания либо неотражённые операции.
Документы — реальность операции. Документ может существовать, а операция не выполняться. Здесь проверяются движение средств по счетам, движение материальных ценностей, данные контрагентов.
Дополнительно оценивается правильность оценки статей: соответствие принятых способов учётной политике и правилам бухгалтерского учёта — от этого зависят стоимость запасов, резервы, признание выручки.
Результатом становится не перечень нарушений, а денежная величина искажения по каждой статье и её влияние на спорный показатель.