Одним документом, а не двумя. Вводная часть у него общая — объекты, поставленные вопросы, сведения об экспертах. Дальше идут исследовательские части, по одной на специальность, и каждую подписывает тот, кто её выполнил.
Из этого следуют две вещи, которые заказчика обычно удивляют. Приложений о квалификации в таком заключении несколько — по комплекту на каждого исполнителя, и смотреть их нужно по отдельности, а не считать по объёму пачки. И выводы могут различаться по определённости: категорический ответ об исполнителе рядом с вероятным ответом о времени — не признак небрежности, а разная информативность двух объектов исследования.
Если сомнения вызывает именно почерковедческая часть, её разбирают отдельно: этим занимается рецензия на заключение почерковедческой экспертизы.