Комплексная экспертиза назначается в случаях необходимости проведения исследования экспертами разных специальностей. В заключении комплексной экспертизы каждый эксперт указывает, какие исследования он проводил, в каком объеме и к каким выводам пришел. Эксперт подписывает именно свою часть заключения и несет за нее уголовную ответственность. При этом эксперты учитывают не только свои результаты, но и результаты других экспертов. Общий вывод формулируется экспертами по результатам, полученными в ходе проведения исследований.
Комплексная почерковедческая и технико-криминалистическая экспертиза документов проводится для установления факта выполнения подписей или кратких записей с предварительной технической подготовкой.