Да, и начинать стоит с расчёта регулятора: обычно видно, какие позиции исключены и по какому основанию.
Оценка позволяет распределить усилия. Часть исключений опровергается документами быстро — затраты подтверждены и предусмотрены методикой. Часть требует обоснования величины и сопоставления с рыночным уровнем. Часть бесперспективна, и спорить по ней не стоит.
Отдельно проверяется база распределения общехозяйственных расходов: здесь нередко и находится основная сумма расхождения, а спор об одной методической позиции обходится дешевле разбора десятков статей.
Результат бывает неблагоприятным: исключения регулятора обоснованы, а расчёт организации построен на распределении, которое не выдерживает проверки. Узнать это до подачи заявления дешевле, чем в заседании.
Прогноз не является заключением, не гарантирует результат и после исследования может уточниться. Если экспертиза назначена судом, назначенный эксперт сторону не консультирует.