Предметом. Экспертиза проектной документации отвечает на вопрос, правильны ли принятые проектные решения: расчёты конструкций, компоновка, соответствие заданию и нормам. Экспертиза проекта производства работ — на вопрос, правильно ли организовано выполнение этих решений на площадке.
Пример разграничения. Конструкция рассчитана верно и в эксплуатации несёт нагрузку, но обрушилась при монтаже, потому что не были предусмотрены временные крепления промежуточной стадии. Проектная документация здесь безупречна, а дефект лежит в организации работ — и находится он только исследованием проекта производства работ.
Обратный случай тоже встречается: монтаж вёлся строго по проекту производства работ, а причина в ошибке конструктивного расчёта. Тогда предметом становится проектная документация — см. экспертизу строительных проектов.
Когда причина заранее неизвестна, вопросы ставят по обоим направлениям: это дороже, но избавляет от второй экспертизы после того, как первая укажет не туда.