Спор о биологическом родстве требовал проверить, исключается ли предполагаемая связь между участниками по генетическим признакам. При совместимости профилей предстояло рассчитать вероятность случайного совпадения признаков у лиц, не связанных предполагаемой связью. Для этой задачи эксперты проводили генетическую экспертизу ДНК. Расчёт строился на сравнении наследуемых вариантов участков хромосомной ДНК. Сначала эксперты формировали отдельный профиль для каждого образца.
Комиссия экспертов организовала лабораторную работу по материалам гражданского дела и биологическим образцам, отобранным в Москве. Эксперты имели подготовку в области биологии, биохимии, генетики, микробиологии и клинической лабораторной диагностики. Они работали стационарно в лаборатории, куда участники прибыли для отбора клеточного материала. Операции с пробами шли последовательно: от выделения ДНК до статистического расчёта.
Эксперты выделили ДНК из буккального эпителия реагентом COrDIS Sprint в программируемом термостате ТТ-1-«ДНК-Техн.». Затем они измерили концентрацию методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Для этого использовали набор «XY-Детект» и анализатор нуклеиновых кислот «АНК-32». По измеренной концентрации эксперты определяли объём реагентов для последующего копирования и сопоставления генетических участков каждой пробы.
- Амплификация — копирование 19 коротких повторяющихся участков ДНК, или STR-маркеров, набором COrDIS Plus на приборе T100 Thermal Cycler.
- Контроль реакции — параллельное использование контрольных препаратов с заданными свойствами.
- Капиллярный электрофорез — разделение продуктов реакции на анализаторе ABI Prism 3130xl Genetic Analyzer.
- Генотипирование — построение профилей по вариантам наследуемых участков хромосомной ДНК.
После разделения продуктов реакции эксперты сопоставили варианты STR-маркеров. Сравнение охватывало признаки, наследуемые в проверяемой биологической связи. При совместимости профилей эксперты рассчитывали индекс родства и байесову вероятность — статистическую меру силы генетического совпадения. Расчёт проверял версию о случайном совпадении признаков у неродственных лиц. Перед статистической оценкой эксперты попарно сопоставляли варианты генетических маркеров.
Эксперты выстроили лабораторную последовательность для спора о родстве от подготовки проб к статистической оценке профилей. Промежуточные данные они фиксировали на электрофореграммах — графиках разделённых фрагментов ДНК. Затем эксперты сводили варианты маркеров в сопоставимую таблицу и рассчитывали вероятностные показатели. Числовые параметры профилей они соотносили с поставленными судом вопросами. Проверка охватывала индекс родства и байесову вероятность.