Спор касался биологического отцовства: требовалось проверить, допускает ли сочетание наследственных признаков предполагаемую родственную связь. При совместимых генетических данных предстояло рассчитать вероятность того, что такое сочетание могло возникнуть у неродственных людей случайно. Судебная генетическая экспертиза решала эту задачу методами молекулярной генетики и биостатистики. Генетические признаки человека рассматривались как система наследуемых аллелей.
Производство имело форму судебной генетической экспертизы. Профиль экспертов включал биологию, биохимическую экспертизу, лабораторную генетику и судебно-медицинскую экспертизу вещественных доказательств. Работа проходила в Москве по материалам гражданского дела и включала очную процедуру отбора биологического материала. По предмету это была генетическая экспертиза для установления отцовства. Такая подготовка связывала лабораторные действия с 2 судебными вопросами.
Эксперты сначала изучили поставленные вопросы и определили состав генетических признаков для проверки биологического отцовства. Затем они отобрали буккальный эпителий с внутренней стороны щеки, оформили протокол и выполнили фотофиксацию. Методическая схема предусматривала полимеразную цепную реакцию: выбранные участки ДНК многократно копируются для последующего анализа. STR-типирование, то есть сравнение вариантов коротких повторяющихся участков ДНК, служило основой для проверки родственной гипотезы.
Статистическая часть строилась на индексе отцовства и байесовской вероятности. Индекс сопоставляет две версии: родство предполагается либо совпадение генетических признаков относится к неродственным людям. Байесовский расчёт переводит это соотношение в вероятность с учётом исходной гипотезы. Так разделялись биологическая совместимость наследственных признаков и численная оценка случайного совпадения. Расчёт относился ко второму, условно поставленному вопросу суда.
При выборе STR-маркеров эксперты опирались на «Методические указания № 98/253 “Использование индивидуализирующих систем на основе полиморфизма длины амплифицированных фрагментов (ПДАФ) ДНК в судебно-медицинской экспертизе идентификации личности и установления родства”». Частоты аллелей для статистических вычислений рассматривались по изданию «Применение частот встречаемости аллелей STR-локусов для повышения идентификационной значимости результатов исследования ДНК: методические рекомендации. — М: ЭКЦ МВД Россия, 2013».