Спор об отцовстве суд мог разрешить только по данным о биологическом родстве. Требовалось сопоставить генетические признаки предполагаемого отца и ребёнка, а затем оценить, насколько вероятно случайное совпадение этих признаков у неродственных людей. Работу назначили как судебную генетическую экспертизу, по направлению это генетическая экспертиза для установления отцовства.
Экспертизу провели эксперты-биологи с подготовкой в области клинической лабораторной диагностики. Биологический материал участники сдали в помещении экспертной организации в Москве: эксперты сами брали мазки, сверяли документы и фотографировали участников.
Лабораторная часть шла последовательно, и каждый этап выполнялся на своём оборудовании:
- Выделение ДНК — быстрый лизис образцов реагентом производства «Гордиз» в программируемом твердотельном термостате «Гном»
- Концентрация ДНК — ПЦР в реальном времени с набором «XY-Детект» на анализаторе нуклеиновых кислот «АНК-32»
- Копирование участков ДНК — ПЦР на амплификаторе T100 Thermal Cycler с панелью COrDIS Plus на 20 локусов
- Разделение фрагментов — капиллярный электрофорез на генетическом анализаторе ABI Prism 3130xl
Локус здесь означает участок ДНК, длина которого различается у разных людей. Типирование по 20 таким участкам выполнялось по Методическим указаниям № 98/253 «Использование индивидуализирующих систем на основе полиморфизма длины амплифицированных фрагментов (ПДАФ) ДНК в судебно-медицинской экспертизе идентификации личности и установления родства». В каждую постановку включали положительный контроль с известным профилем и пробу без ДНК.
Полученные профили эксперты сравнивали по каждому участку и сохранили электрофореграммы, то есть графики разделения фрагментов. Вероятность случайного совпадения рассчитывалась по частотам вариантов этих участков, опубликованным для российских популяций.
