Целью проведения судебной генетической экспертизы являлось установление наличия единокровного братства между двумя лицами, а именно, было необходимо определить, являются ли они единокровными братьями от общего предполагаемого отца, который на момент проведения экспертизы уже скончался. В ходе исследования экспертам предстояло решить сложную задачу по реконструкции части генетического профиля предполагаемого отца, основываясь исключительно на образцах ДНК двух его сыновей. Основная сложность заключалась в отсутствии прямого биологического материала предполагаемого общего родителя (отца), что требовало применения специализированных методов анализа и интерпретации данных для определения косвенного родства. В таких случаях, для повышения достоверности заключения, ключевым было использование как аутосомальных, так и Y-хромосомных STR-маркеров, передающихся по мужской линии без рекомбинации. Эффективность проведения экспертизы осложнялась необходимостью обеспечения строгой конфиденциальности и минимизации рисков перепутывания образцов, что было достигнуто путем тщательной маркировки и ведения протоколов на каждом этапе работы. Экспертами были применены передовые молекулярно-генетические методы, включающие выделение ДНК из образцов буккального эпителия, измерение ее концентрации, последующую полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с использованием мультиплексных панелей STR-маркеров, и электрофоретическое фракционирование продуктов ПЦР. В частности, для аутосомальных маркеров использовался набор COrDIS Plus, охватывающий 19 STR-маркеров и локус амелогенина, а для Y-хромосомных маркеров – набор COrDIS Ystr, анализирующий 18 полиморфных STR-маркеров Y-хромосомы. Эти методы позволяли получить уникальные ДНК-профили каждого участника, которые затем анализировались для определения вероятности родства. Процесс исследования осуществлялся в соответствии с "Методическими указаниями № 98/253 «Использование индивидуализирующих систем на основе полиморфизма длины амплифицированных фрагментов (ПДАФ) ДНК в судебно-медицинской экспертизе идентификации личности и установления родства»", утвержденными Минздравом РФ. Кроме того, применялись методические рекомендации по использованию частот встречаемости аллелей STR-локусов для повышения идентификационной значимости результатов исследования ДНК, разработанные ЭКЦ МВД России. Также в процессе работы учитывались аспекты применения молекулярно-генетической индивидуализирующей системы на основе полиморфизма нуклеотидных последовательностей митохондриальной ДНК, хотя в данном случае основной акцент был сделан на Y-хромосомном анализе. Значимым нюансом являлось то, что Y-хромосомные маркеры наследуются от отца к сыну практически без изменений, что позволяет однозначно подтвердить наличие общего предка по мужской линии. Обработка и интерпретация полученных генотипов требовала глубоких знаний в области генетики и биостатистики для корректного расчета вероятности родства.
В процессе выполнения экспертизы были задействованы специализированные приборы, такие как термостат твердотельный программируемый, настольная центрифуга, магнитный штатив, а также высокоточные системы ПЦР реального времени с флуоресцентной детекцией и ДНК-амплификаторы. Оборудование, включая систему капиллярного электрофореза ABI Prism, обеспечивало высокую точность и воспроизводимость результатов, что критически важно для судебной экспертизы. Особое внимание уделялось полноте состава участников исследования, поскольку отсутствие биологического материала матери или прямого образца предполагаемого отца могло снизить общую долю идентичного по происхождению генетического материала между ребенком и родственником второй степени. Для максимизации шансов на установление истины и повышения достоверности результатов, эксперты использовали сиблинговый тест, который применяется для определения, могут ли участники исследования быть биологическими детьми одного и того же мужчины (или женщины), а также тестирование Y-хромосомы для подтверждения родства по мужской линии. Достоверность генетического исследования оценивалась согласно российскому законодательству, которое регламентирует минимальные значения вероятности родства для не исключения отцовства/материнства (99.90% для трио и 99.75% для дуэта), а при установлении братства использовались вероятностные расчеты, соответствующие степени родства. Таким образом, весь комплекс предпринятых действий был направлен на получение максимально объективных и научно обоснованных выводов по поставленному перед экспертом вопросу.